Почему при установке Windows переносит свой загрузчик на другой диск?

Решил обновить верный ноут Samsung 300v5a-s08: 8 Гб оперативы, SSD на 250 и HDD на терабайт. SSD был воткнут на место старого винта, а терабайтник через переходник вместо привода.
Хотел поставить системы с нуля, естественно на SSD, само собой, через флешку. Ubuntu встала легко, а винда упорно отказывается (нужен именно дуалбут).
Ставил и семерку, и восьмерку — никак. Копируются файлы, установка, первая перезагрузка — и черный экран, только периодически включается и гаснет подсветка.
Потом обнаружил интересную особенность — оказывается винда резервирует системный раздел на терабайтнике (350 Mb) и ставит свой загрузчик туда (размером ~25Mb).
Далее, если загрузить Ubuntu с LiveCD, выставить флаг boot на раздел с Linux, то появляется grub с предложением выбора: Ubuntu или винда с терабайтника. То есть, вопреки обычной практике grub не затирается.
Еще интереснее, что восьмерка таким образом встала нормально. А вот семерка, которую мне и нужно поставить, так как лицензия у меня именно на нее, пишет, что установка на такую конфигурацию компьютера продолжена не может быть.

BIOS у меня очень куцый. Из всех настроек: UEFI Boot Support - вырублен, и режим AHCI - ручной и авто.

Вопросы такие:
Почему так происходит? и
Как можно решить эту проблему? Причем хотелось бы ее решить без выдергивания HDD.

UPD. Выдернул HDD, все встало, как надо. Спасибо за ответы. В случае перестановки клонирование спасёт от отвёртки?

Столкнулся с другой проблемой - поистерлась наклейка. Пошёл гуглить...