Где хранятся задания cron?

в Unix задачи cron-а лежат в нескольких местах:
1. /etc/cron.d - здесь можно создавать файлы с заданиями крону, которые он будет загружать и исполнять по указанному расписанию. в этих файлах нужно указывать пользователя, от имени которого будет исполнено задание
*/10 * * * * root /root/backup.db.sh
2. /etc/cron.daily, /etc/cron.hourly, /etc/cron.monthly, /etc/cron.weekly - здесь кладем скрипты, которые будут исполняться ежедневно, ежечасно, ежемесячно и еженедельно. это такие себе подготовленные расписания, которые подгружаются и исполняются в определенное время
3. crontab -e - исполнение этой команды с ключом откроет текстовый редактор для редактирования заданий крону текущего пользователя. будьте внимательны - эти задания относятся к текущему пользователю и будут исполняться от его имени
соответственно, самый просто способ для динамического редактирования заданий для крона - это манипуляция с заданиями в /etc/cron.d

У тебя вопрос по панели управления для клиентов системы "Йа с понтом хостер-криворучко". Cpanel и вот это вот всё.

К тегу unix оно не имеет ни малейшего отношения.
потому что в юникс можно написать
crontab список_заданий.txt
и все загрузить.
А куда грузить в твоей панели - надо спрашивать пользователей панели, а не юникса.

Впрочем, в любом случае если у тебя там " много однотипных cron-задач", то ты все делаешь неправильно.

Ну вообще-то, если у вас есть рут доступ, то /etc/crontab, как правило.

Если кто-то тоже ищет для freebsd - /var/cron/tabs/ (см man crontab)