Как в YII2 выбрать данные с учетом значения в связочной таблице?

Если я верно понимаю, то если делать через relation, то для решения первой части задачи:

> Как выбрать из модели Personal всех кто связан с одной конкретной клиникой, скажем с clinic_id = 5

relation необходимо строить со стороны Clinic и выбирать всех Personal

> А еще лучше что бы не по одному ID клиники а по нескольким сразу... Если так можно.

выборка value IN (x, y, z) и циклом перебирать модели, вызывая relation

> Еще к тому же должна быть возможность фильтровать по значениям атрибутов модели Personal
> Т.е. например выбрать всех с именем Алексей которые работают в клиниках с ID 5,14,34

отдельный геттер, я думаю.

Для таких операций я бы рекомендовал посмотреть все таки в сторону SQL запросов :)

> Т.е. например выбрать всех с именем Алексей которые работают в клиниках с ID 5,14,34

SELECT *  FROM Personal
JOIN personal2clinic  ON personal_id = id
 	   WHERE clinic_id IN (5,14,34) 
GROUP BY id
HAVING name="Алексей"

> Как выбрать из модели Personal всех кто связан с одной конкретной клиникой, скажем с clinic_id = 5 ... А еще лучше что бы не по одному ID клиники а по нескольким сразу... Если так можно.

SELECT *  FROM Personal
JOIN personal2clinic  ON personal_id = id
 	   WHERE clinic_id IN (5,14,34) 
GROUP BY id

Или один общий универсальный:

SELECT *  FROM Personal
JOIN personal2clinic  ON personal_id = id
 	   WHERE clinic_id IN (5,14,34) 
GROUP BY id
HAVING name LIKE 'Ви%' # вернет: Виталиков, Викторов, Викентиев, Викторий