Как же на самом деле работает include/require в PHP?

Как все происходит на самом деле? Какие области видимости? Зависит ли это от вложенности файлов в системе? Зависят ли области видимости от "вложенности" include/require? Влияет ли на include/require .htaccess

Допустим, я с индексной страницы подключаю Config.php, лежащий в ./core
Config.php подключает файлы из core
Потом подключаю с индексной же страницы модули ./customer/index.php или /admin/index.php
И постоянно сталкиваюсь с недоступностью каких-либо переменных, методов и даже классов
Причем логики никакой не прослеживается

Как это все реально работает? Как правильно подключать модули?

UPD 1
Файловая структура:

/root
---index.php
---action.php
---/core
------config.php
------core.php
------utils.php
---/customer
------index.php
------action.php

core/config.php

<?
require_once "core.php";
require_once "utils.php";
?>

core/core.php

<?
require_once "utils.php";
?>

core/utils.php

<?
function prepare_db_val()
{
...
}
?>

index.php

<?
require_once "core/config.php";
if( isset($_GET['act']))
{
   require_once "action.php"; // не работает
   require_once "customer/index.php"; // работает!
}
?>

customer/index.php

<?
if( isset($_GET['act']))
{
   require_once "action.php";
}
?>

action.php, costomer/action.php

<?
$db_q = prepare_db_val($_GET['val']);
?>