Date.now в php?

Ну вот на данный момент я использую вариант который предложили выше 1000 * microtime(true) и он выводит 1547635778800.4
Точнее я вижу это в базе данных.

Ну это потому что microtime возвращает микросекунды, а не миллисекунды.
Если нужны миллисекунды то можно так round(microtime(true)*1000)

$post_password=$_POST['password']?$_POST['password']:'';
		$microtime=microtime(true);
		$user=$_connect_->query("SELECT * FROM users WHERE login='{$_POST['login']}' ORDER BY 'id'");
		$user_fetch=$user->fetch();
		if($user_fetch==''){
			if($_POST['acept']=='true'){
				$salt='$6$rounds=1000001$usesomesillystri$D4IrlXatmP7rx3P3InaxBeoomnAihCKRVQP22JZ6EY47Wc6BkroIuUUBOov1i.S5KPgErtP/EN5mcO.ChWQW21';
				$db_pass=crypt($post_password,$salt);
				$_connect_->exec("
					INSERT INTO users(
						login,password,count_colum,count_min_width,microtime
					)VALUES(
						'{$_POST['login']}','{$db_pass}',4,55,'$microtime'
					)
				");
.....

Ну я не вывожу на экран то что в переменной я кладу значение переменной в базу.
В колонку microtime. Колонка microtime в таблице users имеет varchar(255) utf8_general_ci
Таблица тоже база тоже utf8_general_ci

newaitix, время в varchar? Вы его для отчетности храните, и сравнивать никогда-никогда не собираетесь?

newaitix,

Ну я не вывожу на экран то что в переменной я кладу значение переменной в базу.

то есть проблему Вы не локализовали? И вполне возможно, что проблема именно в том как Вы кладете данные, а не во встроенных функциях php. Ошибки есть в логах? Запись создается?

P.S.:
$_POST['login'] класть в базу нельзя. Нельзя пользовательские данные без обработки вставлять в sql.