На главной странице QCustomPlot написано, что есть GPL и есть коммерческая лицензия.
У Qt лицензия такая же, если покупать Qt, то дешевле пользоваться QChartView или писать свое. Сейчас это стандартный подход. ПО с GPL лицензией можно продавать, вместе с исходным кодом или покупать коммерческую лицензию.
Формально в исходники можно включить не всё, а только то, что использует чужие библиотеки, а свои библиотеки на чистом C++ не включать, т.е. ПО будет не возможно собрать, да и толком разобраться как оно работает. В этом нет ни чего нет страшного, например исходники программ на Phyton скрыть в принципе вообще не возможно или JavaScript или HTML.
На оборонке доходят того, что переписывают стандартные библиотеки C++
