если пароля не было до этого
mysqladmin -u root password '1234'

если пароль был.
Останавливаем MySQL:
/etc/init.d/mysql stop

Запускаем в режиме без проверки прав доступа:
/usr/sbin/mysqld --skip-grant-tables &

Соединяемся как root без пароля:
mysql

Выбираем активную БД:
use mysql;

Обновляем пароль:
mysql> update user set Password=PASSWORD('новый пароль') WHERE User='root';
mysql> flush privileges;

Завершаем работу mysqld:
fg
"Ctrl+c"

Запускаем MySQL в обычном режиме.
/etc/init.d/mysql start

ИНФА
здесь много можно узнать !

Не путайте серверные сценарии и браузерные, чем вы кликать будете ? Ваш код считал построчно файл и результат в $read положил. Совет вам дал только один, научитесь задавай вопрос так что бы вас могли понять

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
     RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
     RewriteRule .* index.php [L,QSA]

Так как точка входа одна в приложение, создай свой класс(функцию) роута и парси реквесты которые приходят ну и выдавай то что хочешь.
Это для обучения и понимания как что работает но лучше воспользуйся готовыми решениями например как это FastRout

htmlbook.ru/css/z-index выставите в css или js напишите чтобы меняль этот z-index ... и вообще причем тут тег php

p. s.

.site-header {
    background-color: #fff;
    border-bottom: 1px solid #e7e7e7;
    clear: both;
    display: block;
    min-height: 88px;
    opacity: 1;
    position: relative;
    z-index: 30001;             <--------  вообще убрать 
}

в файле /wp-content/themes/i-excel/style.css строка 938
Как уберете эту строчку все у вас наладится))
и еще совет допишите к popup окнам margin-top: 60px; а то прилипает к верху не очень красиво)))