Вторую строчку поменяйте. Скорее всего тут скобки не хватило:)
document.body.innerHTML = document.body.innerHTML.replace(eval("/"+textToFind+"/gi"),"<a name="+textToFind+" style='background:red'>"+textToFind+"</a>")); //Заменяем найденный текст ссылками с якорем;
