Вам нужно написать например RESTful API, через которое приложение будет общаться с сайтом. С этого и "надо начинать".
Ну а как его писать - это уже отдельная тема. Я бы выбрал Symfony + FOSRestBundle, но это, скажем так, как минимум средний уровень знания PHP.

Сдайте экзамен на сертификат ZCE, Symfony, заодно и проверите, не лжете ли вы сами себе в знаниях и нам тоже :)