вот пример реализации на php:

function get_stat( $url, $headers )
{
    $handle = curl_init();
    curl_setopt( $handle, CURLOPT_URL, $url );
    curl_setopt( $handle, CURLOPT_HTTPHEADER, $headers );
    curl_setopt( $handle, CURLOPT_SSL_VERIFYPEER, false );
    curl_setopt( $handle, CURLOPT_SSL_VERIFYHOST, false );
    curl_setopt( $handle, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true );
    $response = curl_exec( $handle );
    $code = curl_getinfo( $handle, CURLINFO_HTTP_CODE );
    return array( "code" => $code, "response" => $response );
}

$url_yandex_disk = "https://yadi.sk/i/byMUqoSLiw3Ki";

$result = get_stat( "https://cloud-api.yandex.net:443/v1/disk/public/resources/download?public_key=" . urlencode( $url_yandex_disk ), array() );
if( $result["code"] == 200 )
{
	$result["response"] = json_decode( $result["response"], true );
	echo '<a href="' . $result["response"]["href"] . '">Скачать</a>';
}
else
{
	echo "error";
}

а здесь работающий пример:
https://getfile.dokpub.com/yandex/

А здесь публикация и получение списка своих файлов на Яндекс диске:
https://getfile.dokpub.com/yandex/publish/

Для тех кто желает генерировать постоянно обновляемые ссылки передаваемые ,например в GET параметре, можно сделать так:

$url_yandex_disk = $_GET["ya_url"];

$result = get_stat( "https://cloud-api.yandex.net:443/v1/disk/public/resources/download?public_key=" . urlencode( $url_yandex_disk ), array() );
if( $result["code"] == 200 )
{
	$result["response"] = json_decode( $result["response"], true );
	header( "Location: " . $result["response"]["href"], true, 302 );
	exit( 0 );
}

а вот на Питоне:

import requests
import pprint
import urllib.parse

targetUrl = "https://yadi.sk/i/03bE933n3PqpG2"
url = "https://cloud-api.yandex.net/v1/disk/public/resources?public_key=" + urllib.parse.quote(targetUrl, safe="")

responseData = requests.get(url)
if responseData.headers["content-type"] in ["application/json; charset=utf-8", "application/json"]:
    print(pprint.pformat(responseData.json()))
else:
    print(responseData)

В некоторых случаях могут возникать ошибки.
Ниже связанные вопросы с текущим ответом:
Как правильно использовать прямую ссылку с Яндекс.диска?

Скорее всего эта проблема связана с БД. Вероятно есть SQL запросы, которые плохо оптимизированы под эту задачу. В этом случае тогда нужно оптимизировать запросы, возможно еще нужно создать индексы, возможно еще произвести тюнинг MySQL, увеличить некоторые буферы и другие настройки.

Для оптимизации нужно:

1. Нужно включить логирование медленных запросов. Много раз использовал эту методику для выявления узких запросов.
После уже можно понять какие php файлы являются проблемными, и их исправить.
Логирование медленных запросов включается так в разделе [mysqld] в файле my.cnf:

slow_query_log      = 1
slow_query_log_file = /var/log/mysql/slow.log
long_query_time     = 1

Анализ лог файла делается так:
mysqldumpslow -s c -t 20 slow.log.1 > results.log

2. Также может помочь утилита mysqltuner.pl. Многократно ее использовал для определения проблемных запросов, индексов, которые нужно добавить в таблицы, и других проблем с MySQL/MariaDB.

3. Можно вручную провести анализ запросов при помощи EXPLAIN.

4. Можно сделать замеры выполнения кода, как вручную, через логирование блоков кода, так и через XDebug. И выявить долго выполняющиеся блоки, после этого оптимизировать их.

5. Кроме того нужно посмотреть процессы на сервере, которые занимают много процессорного времени и памяти, это можно сделать через atop или другие подобные утилиты. Можно на основании этого оптимизировать программный код и службы.

6. То что MySQL и сам сервер находятся на виртуальной машине это тормозит работу сервера, виртуальные ноды в любом случае работают медленнее, чем физический сервер. Рекомендую перенести это все на физический сервер с NVMe дисками, с современным процессором и ОЗУ не менее 128 Гб.

Могу помочь настроить логирование, анализ этого и выявить узкие места.

Готовых решений нет, вам скорее всего самому придется написать Личный Кабинет, биллинг, систему уведомлений и т.д.