Зачем нужно делать отдельную страницу для регистрации?

Лучше конечно. Главное чтобы глюков со скриптами не было. Я бы не отказывался от отдельной страницы, как резервной именно по этой причине.

Часто встречаю, что для формы регистрации делают отдельную страницу. Разве не лучше для конверсии делать попап или располагать регистрацию на самой странице?

Мона сделать и регу при заказе, и отдельную страницу с формой регистрации. Для конверсии лучше когда пришел - увидел - заказал, без лишних запар. Можно и без регистрации. Отдельной страницей рега бывает нужна когда нужно без заказа что-то посмотреть, мб доп опции которые без регистрации не видно.