Как узнать, за какой программой забиты определенные горячие клавиши?

Попробуйте через диспетчер задач завершать процессы всех программ по одной, одновременно проверяя комбинацию клавиш ctrl+shift+a в Sublime Text. Если при отключении определенной программы Sublime Text начнет реагировать на эту комбинацию, то эта программа и перебивает.
Хотя мне тоже кажется, что даже если комбинации клавиш совпадают с другой программой (которая работает в фоновом режиме, но отлавливает глобальные нажатия клавиш), то должно выполняться действие и в Sublime Text, и в той программе.