Задать вопрос
@cthulhudx
базы-данных

Секвенированные геномы. Откуда достать?

Скажите пожалуйста, есть ли базы геномов + исходных ридов. Пишу(для себя) геномный ассемблер, и мне нужно на чем-то проверять его работоспособность.
  • Вопрос задан
  • 3206 просмотров
Комментировать
Подписаться 1 Оценить Комментировать
Решения вопроса 3
@vilgeforce
Раздолбай и программист
www.ncbi.nlm.nih.gov/genome - оно? Если да - проверяйте настройки гугла, ибо это первый результат по запросу "genome database"
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
amark
@amark
rush less, feel more
www.ncbi.nlm.nih.gov
ncbi + подразделы
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
mr_more_distortion
@mr_more_distortion
Мол.биолог/иммунолог/биоинформатик(учусь)
ftp://ftp.ensembl.org/pub/

Выбираешь любой релиз и папочку FASTA. А смотря какой геном нужен. Если нужны риды (формат *.fastq) - искать в публикациях по таким темам, это в NCBI. Если какие-то собранные/недособранные геномы - это в ensembl всё есть.
Ответ написан
Комментировать
Комментировать
Пригласить эксперта
Ваш ответ на вопрос

Войдите, чтобы написать ответ

Войти через центр авторизации
Похожие вопросы
Вакансии с Хабр Карьеры
Разработчик баз данных PostgreSQL
Объединенные системы управления транспортом • Москва
До 220 000 ₽
DBA / Администратор баз данных PostgreSQL
СберТех • Москва
от 320 000 ₽
Программист C++ Builder / базы данных MySQL
RU Electronics • Москва
от 180 000 до 200 000 ₽
Ещё вакансии
Заказы с Хабр Фриланса
Нужен директолог с опытом работы
19 апр. 2024, в 10:02
6000 руб./за проект
Помощь с парсингом XML файла яндекс товаров
19 апр. 2024, в 09:46
500 руб./за проект
Обработать массив фотографий
19 апр. 2024, в 08:46
5000 руб./за проект
Ещё заказы