Два блока, первый выше второго по z-index и не дает возможности нажать на ссылки в нижнем, как сделать их кликабельными?

Может так подойдет
Если подходит, тогда ван нужно свойство:
pointer-events: none;

z-index сравнивается у элементов одного уровня. У обёртки ссылок z-index меньше, чем у соседнего блока, поэтому он его и перекрывает. Вам нужно задать у обёртки (div'a) z-index больше, чем у других div'ов.