Существует ли литература по вирусоведению?

Вы никогда не сможете быть на 100% уверены в чистоте своей системы, даже если вы только что форматнули хард и поставили на него лицензионную винду.
Антивирус - вообще штука сомнительная. Голова на плечах куда полезнее будет. А без нее, как вы сами понимаете, и антивирус не поможет.
Соблюдая элементарные правила безопасности можно обезопасить себя с довольно высокой вероятностью и без антивируса, а именно: сомнительные файлы не открывать, сомнительные флешки не втыкать, сомнительные сайты не посещать. В общих чертах это все.
Я, например, уже давно сижу без антивируса и с отключенным файрволом. Изредка из любопытства проверяю комп утилитами типа Dr. Web CureIt, но они как правило ничего не находят.

habrahabr.ru/hub/virus

Согласен с остальными, 100% гарантии не даст ничего, можно за 5 минут сфорганить вирусню, которую антивирусы посчитают нормальным приложением и лишь после того как пострадает большое число машин его заметят и добавят в базы сигнатур. Единственное что поможет от 99% зловредов это голова на плечах.

Посмотрите документацию из раздела Обучение в «Доктор Веб»
https://training.drweb.ru/ (анализ активных заражений, антивирусная система защиты предприятия и др.)