Ищете файл /admin/model/catalog/product.php, в двух местах в районе 95 и 250 строчки и закомментируйте 2 строчки из 4
prntscr.com/befwtv
Теперь у Вас будет только односторонняя связь меду товарами, то есть к товару А будет рекомендоваться товар Б, а к товару Б рекомендоваться товар А уже не будет.
если у вас уже есть в системе лишние связи (у товара Б есть рекомендация товара А), то можете закомментировать только одну строчку, тогда лишние связи рекомендаций товара А к товару Б пропадут при следующем редактировании карточки.
