Аккумулятору все равно, как часто вы будете включать и отключать зарядку.
Главное чтобы точно выдерживалось напряжение заряда, не превышался ток заряда, и не возникало перезаряда.
Все эти параметры должен обеспечивать контроллер заряда.
Просто смотрите чтобы у вас был хороший контроллер.
Для более точной информации укажите тип батареи, тип контроллера заряда, и батарей.
Простой
