Как в Yii2 Advanced добавить через Composer в папку ..\frontend\web\css\ twitter bootstrap 3?

Bootstrap 3 устанавливается автоматически при установке Yii2 Advanced

Вот только все что устанавливается через composer попадает в папку vendor
Далее через assets менеджер он попадает в публичную папку assets

Если по какой-то странной причине Вам надо его перенести - сделайте это ручками. Отключив его в конфиге и подключив вручную.

Я бы оставил его там где он есть, тогда он будет обновляться. И все будет работать.