Как лучше верстать сайт для Laravel?

Elixir - это просто надстройка над gulp, которая заточена под те пути, которые предусмотрены во фреймворке по умолчанию. Она, скажем так, более ориентирована на бэкендеров, которым лень разбираться во всей этой фронтендерской фигне и хочется просто сделать сайт (с минимальными знаниями вёрстки, разумеется).
Вы можете работать так, как комфортно вам - это фреймворк, а не Коммунистическая Партия Советского Союза.