Генерация pdf вместе с графиками?

https://github.com/mpdf/mpdf
Нормальная либа.

Графики это отдельная песня, они на JS и ни к PHP, ни к PDF не относятся, надо рендерить картинку и вставлять в пдф. Либо на html+css графики на выходе получать, чтобы конвертнуть в пдф.

wkhtmltopdf + Snappy. Графики должны быть встроены в HTML. Если это картинки - то в src должно быть data и base64 этой самой картинки. Если HTML+CSS - CSS должен быть также интегрирован в HTML.
Это в самом простом варианте. А так должно ещё подключение внешних ресурсов работать. Но по опыту не всегда хорошо отрабатывает.