Возьмите любую программу резервного копирования (которая Вам понравиться, коих целая тьма) и выставьте в место копирования папку гугл-диска, уверен, так можно. Ещё можно попробовать подключить гугл-диск по WebDAV-протоколу как сетевой диск, если с указанием папки гугл-диска что-то пойдет не так.
Думаю, касательно "каши в папке назначения", есть много программ, которые умеют создавать архивы. Для скорости - можно добавить режим архивации без сжатие (выставить сжатие на 0), поставить "автоматическое дополнение архива", что бы архивировались только измененные файлы и так далее. Просто "поиграйте" с настройками программы для архивации, одной, второй, третьей... их реально очень много и полно бесплатных, практически под любую ОС.
Простой
Простой
Простой
