Чем отличается LAMP от установки по отдельности?

Тем, что будет больше понимания того, как эти "черные ящички" работают, как стыкуются друг с другом и как можно обновить только один из них.
Да, можно водить автомобиль, даже не заглядывая под капот - и многая многих так именно и ездят :) Но знание того, как устроен автомобиль - даже на самом примитивном уровне полезно.

ничем
ламп это просто линукс апачи мускул пхп
то же ставится по сути по отдельности