Шумит и щёлкает как старый, так и новый винчестер. В чём может быть проблема?

Ну шуметь и щелкать винчестер может просто потому что шумный.
Шум это не показатель проблем, вообще чем быстрее диск, тем шумнее как правило.
У многих даже есть настройки - можно снизить уровень шума в ущерб скорости.
Надо не на шум ориентироваться, а на показания смарта.

А блок питания проверить надо бы - 50% проблем с винтами возникают из-за некачественного питания.

Если это второй диск то возможно он выключался за отсутствием активности, а теперь кто то мешает ему спать.
Если первый и единственный то возможно ему питания не хватает.

Купите ssd шуметь не будет, гарантирую