Как правильно работать со сборкой JS проекта в GIT?

Получается что есть две папки, с исходниками и готовые после сборки файлы. При этом готовые меняются всегда после сборки и при смене веток/сравнении/слиянии бывают конфликты. Но готовые собранные файлы нужно сохранить в GIT. А во время разработки и слияний они мешают.

После
git update-index --skip-worktree
Не возможно поменять ветку и git stash не работает, так как не видит изменений

Your local changes to the following files would be overwritten by checkout

Как правильно это всё сделать?