Запрещать ли индексирование сайта?

А что такого в вашей заглушке, что она прям как третье пришествие ожидается?
Все зависит от того, что было с сайтом до его постановки на тех. работы или что там у вас...
Если домен новый то "до лампочки", а вот если нет!... Тут очень много вопросов возникает.
Если не новый, определитесь нужны ли вам все те страницы, которые уже имеют определенный вес, иначе они просто выпадут из индекса. Если да, тогда заглушка заглушкой, а нужные урлы тоже надо оставить.
И вообще кто этот бред с заглушкой придумал то???
Пусть сайт себе работает как работал! Это в любом случае лучше чем заглушка! А как будет готов апдейт - залили ночкой темною и все довольны. А смысла от заглушки ровно столько, сколько от того человека, который ее придумал.
Заглушка актуальна только если домен новый и сайта нет ещё. А с тех работами вы это бросьте.

www.nestor.minsk.by/sr/2007/08/sr70807.html

Не включайте заглушку.
Если включите, вы потеряете и потенциальных клиентов, и возможны проблемы с индексированием.
Если не включите, потеряете только клиентов.