Недорогой сервер для ESXi(win2008r2,freebsd)?

Лучше не ESXi, а hyper-v. Вы просто в бесплатной лицензии ESXi будете иметь ограничения заметные, а под hyper-v у Вас будет плюс — отличная интеграция с win2008R2.

Фряху, правда, не запускал под hyper-v. Но я бы её на centOS подменил ради такого.

В результате в 30к можно вполне уложиться, т.к. домен не требует особо, шлюз тоже. А hyper-v потянет любое железо, в отличие от ESXi, у которого список гораздо уже.

Если же ESXi всё же, то берите материнку от Intel и ESXi с ней хорошо уживётся.
Железо лучше проверять на совместимость на сайте vmware заранее.

Будете выбирать — обратите внимание на две вещи: RAID-контроллер (под датастор для машин, сам ESXi станет и на SATA и на флеш) и сетевую берите Intel. Всё остальное уже не так важно.
Вот тут: www.vm-help.com/esx40i/esx40_whitebox_HCL.php есть довольно большой список официально неподдерживаемого, но проверенного железа под ESXi.

Особой нагрузки данные сервисы давать не будут, а вот стабильность им необходима в первую очередь. Так что лучше берите брендовое железо с маркировкой «VMware Ready». В 30 тысяч правда будет очень проблематично вписаться.

Если не делать из контроллера домена файлопомойку, то вполне подойдет любой raid контроллер из HCL, умеющий RAID 1, такой будет стоить <300$.

В качестве альтернативной идеи — можно посмотреть в сторону дешевых NAS (умеющих NFS или iSCSI), из списка VMware Certified, например от Iomega или Synology + бездисковый сервер с flash'кой.