Прежде чем удалять /data/2017, мне нужно точно убедиться, что данные берутся именно из /mnt/2017.
1. Отключите в конфиге nginx использование /data/2017 и станет сразу все понятно, откуда будут браться ваши данные.
2. Не удаляйте /data/2017, а просто переименуйте например в /data/2017.old, поживите так N дней, проверьте что все работает корректно.
3. Анализируйте access.log на предмет 404 для файлов которые лежали в /data/2017, а сейчас уже берутся из /mnt/2017
4. Только убедившись, что все хорошо, удаляйте /data/2017
