Как создать файл .ssh в Windows для работы с Homestead (никогда не работал с SSH)?

1. .ssh это не файл, это папка в домашней папке пользователя.
2. При генерации ключей создаётся открытый и закрытый ключи. Первый остаётся на месте и используется для авторизации, содержимое второго нужно вставить в файл ~/.ssh/authorized_keys на удалённой машине, отдельной одной строкой. (~ это домашняя папка нужного пользователя, под которым вы потом будете заходить на удалённую машину).