Какие стандарты на инсталляцию ОС на файл сервер?

Никаких стандартов не существует, есть перечень задач по ТЗ. Проходят как указание услуг, про лицензию на сервер и ее амортизацию - лучше спросить у юриста - там много всяких вариантов, если бухия поставит сервер как поставляющийся сервер без пользовательских лицензий, как часть комплекта ОС, у которого один срок амортизации, то это один случай, если поставят как отдельно сервер как ОС, и лицензию на него, как НМА - это другой случай.

Добрый день.
Вы говорите о разделе "перечень документов, на основании которых создается система, кем и когда утверждены эти документы". Это не обязательно должны быть стандарты.
На сколько мне известно, стандартов для установки ОС нет. Зато есть официальные инструкции производителя (Microsoft), которые уместно упомянуть. Пример: https://www.microsoft.com/ru-RU/download/details.a...
Кроме официальных инструкций на процесс установки могут влиять внутренние инструкции и стандарты заказчика. Информацию про них следует уточнить и, если нужно, включить в ТЗ.