Как мне сделать массив полученные значение из mysql?

db.query(sql, [user.id], async (err, result) => {
  if(err) console.error(err);
  var res = await Promise.resolve(result);
  console.log(res);
});

function foo(callback) {
	var x = 'asdfg';
	callback(x);
}
foo( data => {
	console.log(data);   // asdfg
});

function foo(callback) {
	var x = 'asdfg';
	callback(x);
}
foo( async data => {
	var data = await Promise.resolve(data);
	console.log(data);   // asdfg
});

let db = require('../bin/db');
global.Promise = require('bluebird');

let User = {
    theme: function(id){
        return requestUser('SELECT id_theme FROM access WHERE id_user = ?', id);
    }
};

function requestUser(sql, req){
    return new Promise((resolve, reject) => {
        db.query(
            sql,
            [req],
            (err, rows) => {
                if(err) reject(err);
                resolve(rows);
            });
    });
}

module.exports = User;

const User = require('./model/user');
...
.get('/index', async ctx => {
        if(!ctx.isAuthenticated()){
            await ctx.redirect('/');
        }
        let user = ctx.state.user[0];
        let themes = await User.theme(user.id).then(theme => {
            return theme;
        });
        await ctx.render('index', {
            title: 'Главная страница',
            userBy: user,
            themes: themes,
        });
    })

function theme(userId) {
  return new Promise( resolve => {
    var theme = ... // здесь код нахождения нужных данных и передачи их, допустим, в переменную theme
    resolve(theme);
  });
}

User.theme(user.id).then(theme => {
  ctx.render('index', {
    title: 'Главная страница',
    userBy: user,
    themes: themes,
  });
});

function requestUser(sql, req){
    return new Promise((resolve, reject) => {
        db.query(
            sql,
            [req],
            (err, rows) => {
                if(err) reject(err);
                resolve(rows);
            });
    });
}

function requestUser(sql, req){
    return new Promise((resolve, reject) => {
        db.query(
            sql,
            [req],
            (err, rows) => {
                if(err) reject(err);
                resolve(rows);
            });
    }).then( rows => { return rows; });
}

if(!ctx.isAuthenticated()){
  await ctx.redirect('/');
}

var state = ctx.state;

var user = state.user[0];                 // чтоб ваш код дальше так же работал
state.title = 'Главная страница';
state.userBy = user;

let themes = await User.theme(user.id).then(theme => {
  return theme;
});
state.themes = themes;

await ctx.render('index');     // хотя, await мне тут продолжает казаться лишним