Как запрограммировать мышь?

Наверное, если добраться до внутреннего софта мышиного контроллера, то можно (если он не с одноразовой записью программы - а скорее всего он одноразовый). Не исключаю, что и через драйвер мыши можно, если производитель специально оставил соответствующую лазейку.
"Универсальной проги" для таких настроек лично я не видел никогда. Также никогда не видел ни возможности перепрошить мышь (хотя не исключено, что такие мыши есть), ни возможности управления контроллером мыши из ОС (ПМСМ, мышь только выдаёт сигнал, но не получает).