Flask + Python3.6 + Atom + MacOs?

Трабл
создаю виртуальное окружение, активирую его
virtualenv venv
source venv/bin/activate

устанавливаю фласк
pip install flask

при первом запуске Atom Runner app.py все хорошо
при последующих выдает ModuleNotFoundError: No module named 'flask'

используется Flask + Python3.6 + Atom + MacOs сиера
как это лечить?