Как настроить деплой изменений?

Установил vagrant на windows, настроил синхронизацию папок. В PyCharm настроил удаленный интерпретатор и маппинги. Настроил деплой. При попытке сохранить сначала писало "No files or folder found ind proccess". Затем, после шаманских действий с настройками деплоя, получилось добиться чтобы изменения улетали на вм. После того как я закрыл PyCharm, а затем снова открыл, при любом изменении файла получалось так, прилетали какие то внешние изменения, и файл становился пустым.
Как правильно настроить деплой так, чтобы файлы не перезатирались ?