Привет, что-то совсем никто ничего не пишет (
Смысл бандлов в чем - существующие скрипты объеденить в один и этот один файл разместить на сервере, поправьте, если я не прав. То есть, в режиме дебага у вас отдаются имеющиеся файлы, а в режиме релиза, эти файлы вначале склеиваются на сервере. А потом отдаются уже готовые файлы. Я сталкивался с бандлами давным-давно, когда только учился, а потом благополучно их выпилил и не возвращался больше. Так что прошу прощения, если чего-то напутал, но должно быть именно так и это принципиальный момент.
Если у вас динамически создающиеся скрипты (когда вы средствами разора формируете вёрстку с вкраплениями js), то, получается, что под каждый запрос каждого пользователя у вас появляются свои, разные файлы. Динамически созданные страницы отдаются пользователю, но на сервере ничего не остается. Если под каждый запрос будет вначале проходить процесс связывания и минификации, то это будет нереально долго. Вот один раз такое проделать и потом отдавать всем один закешированный файл - это быстро. А под каждый запрос такое делать, это будет нереал.
В общем, ответ на ваш вопрос - этот механизм не позволяет добавлять динамически сформированные скрипты в бандлы.
На самом деле, если у вас невозможно выделить js код в отдельные файлы, значит, что-то не так со структурой проекта и js кода в нём.
Попробуйте (в целях саморазвития) посмотреть как решаются ваши проблемы в других проектах. К примеру, в студии есть шаблон .net core + angular, в нём уже настроен webpack, который выполняет примерно такую же функцию, как и бандлы (но он тоже не справится с вашей проблемой).
Смысл в том, что вы вначале из c# создаете скрипт, который сразу заполнен инициализированными значениями, но при обновлении (думаю, что вы через ajax обновляетесь?) у вас есть методы, которые принимают данные через api и обновляют те самые значения на странице, по сути кода становится если не в два раза, так в полтора больше. В spa решениях оставляют только работу через api, то есть не будет динамических скриптов, поэтому весь такой js код остается статичным, его можно связывать и минифицировать.
