Как сделать такое портфолио?

Забавно -- тоже подгляев с этого новосибирского сайта идею делал свое решение :)

Это стандартный вывод у Апача, если включить вывод файлов
Конкретно - -вот оно: https://oupala.github.io/apaxy/

Я например делал чуть через другую библиотеку https://maksfedorov.ru/done/
https://github.com/DirectoryLister/DirectoryLister

Если у вас Апач -- нашел вот еще красивый вывод (при чем вывод расширений свежий)
https://github.com/Vestride/fancy-index


Ну и для Nginx (вы же не работаете с Апачем, надеюсь) нашел решение: https://github.com/Naereen/Nginx-Fancyindex-Theme

Портфолио нужно делать самому, а не подглядывая у других, в этом же смысл -_-
На gh-pages сделать подобное можно

И чем так привекателен стандартный листинг своей папки апача?
Это не то что на портфолио, это на какой-либо веб-ресурс в 2018 году не тянет. Любой уважающий себя «тот-кто-берет-вас-на-работу» именно с таким портфолио и не возьмёт.

Что-то мне подсказывает, что у ребят что-то слетело или не настроен индексный файл для директории.