Для начала посмотреть логи гипервизора.
Помониторить нагрузку на основные компоненты гипервизора - процессор, память, диски.
Проверить SMART дисков.
Если проблем не видно -
сделать трассировку загрузки внутри виртуалки и посмотреть что конкретно долго грузится, после чего разобраться почему это происходит и устранить причину.
При таком объеме информации что был дан в вопросе, сколько-то значимый ответ дать не получиться, если конечно не прибегать к гаданию на кофейной гуще. Но кофе я уже допил, и гущу вылил. Увы.
P.S. Картинка шикарная, очень информативная познавательная и наводит на множество умных мыслей.......
