Злоумышленники могут перехватывать и изменять сообщения Whatsapp в групповых или приватных чатах. Насколько это применимо практически?

Вероятность целенаправленной атаки очень низкая ибо непросто и недешево.
Вероятность того что в чате Whatsapp будет передаваться критически значимая информация тоже ниже плинтуса.
Вывод - не опасно.

Насколько это опасно практически?

Ровно настолько, насколько для Вас является допустимым передавать в чатах whatsapp какую-либо приватную информацию

Самый просто вектор атаки это подстава. Например когда самый простой обмен котиками превращается в приобретение веществ. Можно сценарии попроще: любовницы, внебрачные дети и т.п. Ну а дальше обычное вымогательство и шантаж.
Отлично работает на людях высокого ранга, всяких чиновниках и начальниках, разного рода сотрудниках всяких служб, да и простому человеку можно нервы нехило так потрепать.

Другой вектор атаки - слежка за конкурентами, преднамеренное искажение информации. Самый простой способ - немного поменять цену на товар, сдвинуть дату начала акции или что-нибудь в этом духе. Короче мелкие подсёры, которые будут отравлять атмосферу в коллективе.

Это очень "странная" мягко говоря атака, она подразумевает получение приватных ключей сессии. Простыми словами это все равно что в статье "как взломать любую квартиру за 5 минут" написать "начнем с того, что сделаем копию всех ключей".