У меня на чистой установке WordPress нету раздела с путями загрузки файлов
В базе данных храниться только часть пути, опция upload_path(по умолчанию пуста). А полный путь формирует php, файл \wp-includes\functions.php
Также если задана константа UPLOADS, путь будет браться из определенного в этой константе значения
Вот вырезка из описания функции wp_upload_dir()
/**
* Get an array containing the current upload directory's path and url.
*
* Checks the 'upload_path' option, which should be from the web root folder,
* and if it isn't empty it will be used. If it is empty, then the path will be
* 'WP_CONTENT_DIR/uploads'. If the 'UPLOADS' constant is defined, then it will
* override the 'upload_path' option and 'WP_CONTENT_DIR/uploads' path.
*
*/
