Как установить nodejs на VPS(VDS)?

Для установки Node.js надо выполнить инструкции по установки с сайта и можете подключатся и работать. Контейнеры по сути не нужны.
Если же вы сильно хотите завязать всё на докере, то придётся, чуть ли не Continius Integration пилить, с пере сборкой образа контейнера и перезапуском его после нового коммита в репозиторий.
Ну и самое главное, большинство бесплатных VPS на OpenVZ виртуализации, а с ней докер не очень дружит.

Простейший способ
https://github.com/creationix/nvm
Для нативных модулей нужны еще будут
build-essential python и зачастую openssl libssl-dev

в данном случае советуем вам рассмотреть создание и работу именно в разрезе работы с Docker-контейнером, в котором вы можете настроить контейнер под свои нужды и разворачивать проект на любых серверах - https://nodejs.org/ru/docs/guides/nodejs-docker-webapp/ .
При необходимости вы можете воспользоваться нашими готовыми решениями, в том числе и сервером с предустановленным Docker - https://timeweb.com/ru/solutions/os_po/

Докеры лучше ставить на VPS с kvm, openvz это по сути тоже контейнер, без полноценной виртуализации.

>Могу я создать у себя такой репозиторий с нодой
да, можно поднять свой гитхаб, но потребуется впс с ресурсами серьёзнее.