Почему в конструкторах прототип назначается с помощью prototype, а не с помощью __proto__ или Object.create()?

The prototype is a property on a constructor function that sets what will become the __proto__ property on the constructed object.

function Foo() {
}
Foo.prototype.x = 5;
const foo = new Foo();
console.log(foo.__proto__ === Foo.prototype); // true