Как автоматически переключать на ветку при клонировании?

При клонировании в рабочий каталог распаковывается не ветка master, а текущая ветка.
Единственный способ изменить это поведение – при клонировании указать какая конкретно ветка вам нужна.
git clone --branch <branchname> <remote-repo-url>
Либо вообще ничего не распаковывать сразу. Распаковывать можно позже.
git clone --no-checkout <remote-repo-url>