Максимальное кол-во папок в одной папке (ext4)?

Но тут быстрее inode'ы закончатся у него)

SagePtr, так 2^32 это и есть максимально возможное кол-во iNode в ext4, 4 байта на уникальный номер и дает примерно 4 млрд айнод.

так а будут ли тормоза если 1 млн папок в одной папке, при заходе в каталог по ssh или при запрашивании файлов из папок через nginx? При каких будут тормоза?

Ясно, что групповые операции над этими папками будут тормозить

Иван, тормозов не будет. Будут при попытке получить список папок, либо удалении при удалении.