Возможно создать ссылку (html) на файл внутри архива (ZIP, GitHub Pages)?

Нет.

Как вариант, можно сделать html-файл, внутри которого таблица со списком всех файлов, который нужно засунуть в сам архив. Гиперссылку указать в относительном виде, а именно:
<a href="1.docx"target="_blank">Открыть</a>.
Гиперссылка будет работать если zip-архив открыт.
Список необходимых файлов в виде html таблицы можно сделать скриптами vba.
При необходимости могу поделиться.