Как говорил Дмитрий Елисеев: «Да, представьте себе, в Yii можно использовать обычные php классы...».
Если вы хотите создать свой хэлпер то сделайте это там, где вам удобно. Что такое хэпер? Это обычный вспомогательный php класс. Если у вас проблема его размещения и вы хотите придерживаться структуры проекта, то обычно для хэлперов используют папку helpers в модулях или самого приложения, где и размещают все свои хэлперы.
Если вам нужно добавить свой метод в базовый Html хэплер, то свой хэлпер класс Вы наследуете от базового... Главное, чтобы в хэлпере не было бизнес-логики. Тогда это полноценный хэлпер. Но если это логика, то тогда это не хэлпер. И, скорее всего, вам придется его добавить в модель.
