Если в договоре указано, что он подписывается электронной подписью
Ну если так написано, значит надо его подписывать электронной подписью, получать сертификат и открытый ключ в УЦ и подписывать.
нажатием кнопки
Какая разница каким способом вы запустите софт подписывающий докуменнт? Это не обязательно указывать.
тем самым несет юридическую ответственность и подпись расценивается как собственноручная на бумажном носителе
Ни в коем случае, электронная подпись и собственноручная это разные вещи. А про какую ответственность идет речь непонятно.
Простой
