Как установить MS-DOS на HDD и поставить поверх Windows 3.1?

Скачайте готовый образ виртуальной машины с win 3.1 и запустите его.
old-dos.ru/index.php?page=files&mode=files&do=show...

Около 4 года назад, я занялся разработкой программы установки MS-DOS 6.22 из под windows, за эти 4 года программа была довидена до ума.
За основу был взят инсталятор fenixos на базе загрузчика grub4dos, который устанавливал android из под windows.
DOS ставится на физическое железо side-by-side, при загрузке можно будет выбрать какую систему загружать(MS-DOS, WINDOWS).
Программа написана на visual basic и bat.
В DOS:
-Установлен драйвер usb.
-Установлен драйвер мышки.
-Установлен Volkov Commander.
-Установлен драйвер cd-rom, дисковод обозначен буквой w.
-Добавлена поддержка NTFS.
-Добавлена поддержка fat32
-Есть ramdisk.
-Есть выбор: установка,переустановка,обновление.Если на диске нет старых версий или данной версии, то будет выполнена простая установка.
-Поддержка русского языка.
-Смена раскладки клавиатуры (shift+shift)
-Замедление процессора для программ запущенных через vc.
-Обновлён дизайн, так не понравившийся некоторым пользователям.
-Есть возможность установки из некоторых систем win 8, 8.1, 10
-Полная поддержка инсталляции из win xp, vista, 7.

Скачать программу можно с old-dos.ru/dl.php?id=22253

> Чем его записать на флешку и как?
dd или dd for windows

> Как затем, с флешки поставить Windows 3.1?
Если BIOS умеет, то можно принудительно задать тип HDD для USB-флешки, тогда в DOS она будет видна как обычный жесткий диск, только вынимать на горячую не желательно.

Если совсем хардкорно, то можно погуглить эмуляторы FDD на картах памяти. Для Commodore и ему подобных подобное делали. Заливаешь образы дискет на флешку и выбираешь их кнопками на устройстве.

Файлы win 3.1 нужно любым образом скопировать на HDD, это всего лишь оболочка над DOS, у нее нет загрузчика. А для установки DOS нужно загрузиться с дискеты или CD. Как вариант использовать usb floppy дисковод, если возможно.
http://ms-dos.biz/ms-dos-7-установка-команды-ms-dos/
old-dos.ru/files/file_322.html

Добавлю что нужно:
- не забыть отформатировать раздел в нужную FS (не уверен что даже FAT32 подойдет)
- озаботиться клавой/мышкой, подключенными через PS/2 хотя бы (USB тогда еще небыло)