Установленные библиотеки в виртуальное окружение, так же устанавливаются во внешнее окружение, как исправить?

Вы "глобально" какую-то фигню творите. Но чтобы понять какую конкретно, протокол действий на стол.

возможно Вы не до конца понимаете как работает виртуальное окружение?
оно действует только в рамках одной сессии.
Так же убедитесь что изменилась строка подсказки.

ПС: там есть ключ запуска для того чтобы видеть глобальные библиотеки но думаю это не Ваш случай

Andy_U, я создаю папку, захожу в нее через командную строку, ввожу команду virtualenv venv, у меня появляется папочка venv со всем необходимым, я ввожу venv\Scripts\activate, у меня перед путем к папке появляется (venv), и когда я ввожу pip freeze у меня отображаются все библиотеки из внешнего окружения, и соответственно когда устанавливаю что-то или удаляю они тоже общие.

le1T,

когда я ввожу pip freeze у меня отображаются все библиотеки из внешнего окружения

А не должны, если вы при генерации среды не задали параметр --system-site-packages... Покажите еще вывод команд pip list, path и where pip.

Andy_U, вот:

le1T, Нет, команды нужно было запустить из вашей рабочей директории (которая E:\Python ПО\TelegramBot) после activate...

Впрочем, не надо. Смотрите на ответ.