Как настроить доступ в Jira чтобы пользователь видел только свой проект?

1. Создать группу project-for-user, включить в нее пользователя.
2. Далее Система - Проекты - ваш_проект - права доступа
3. В левом столбце ищите право доступа "просмотр проекта" и меняете группу вашу.
Аналогично можно назначить и другие права в рамках этого проетк (добавление наблюдателей, изменение таска, удалеие и т.д.).