Как передать в require() путь за пределами node_modules?

Используйте переменную окружения NODE_PATH
вот к примеру структура

app
 |-modules
   |-module_a  
   |-module_b
   `-module_c
 |-controllers
 `-views
 index.js

При запуске можно указать переменную NODE_PATH=./modules и обращаться к папкам в папке modules, как словно они лежать в node_modules
import moduleA from 'module_a'
Так-же если у вас webpack то можно настроить алиасы
или обращаться от корня через @
import moduleA from '@/modules/module_a'