Как сделать карту яндекса адаптивной?

Никак. Яндекс не знает, что размер окна браузера может меняться. Однако если вы поменяете размер окна, а потом перезагрузите страницу - все будет нормально и ничего за края не будет вылезать. Впрочем можно попробовать поиграть с js, так, чтобы рефрешить карту в ручную.

Ок а как обратиться к карте чтобы поменять её высоту на медиазапросе ? Пробовал добавить класс к карте но браузер не видит.